Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VGFO15240 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VGFO15240 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VGFO15240 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VGFO15240 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VGFO15240 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VGFO15240 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms