Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNPATO15228 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GNPATO15228 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNPATO15228 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GNPATO15228 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GNPATO15228 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GNPATO15228 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GNPATO15228 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms