Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLGNO14967 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms