Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EBAG9O00559 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms