Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIP1O00291 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIP1O00291 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms