Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNAP23O00161 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms