Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KRW8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
J3KRW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
J3KRW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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