Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN34H7C241 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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