Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6orf229H3BNL8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6orf229H3BNL8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms