Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRRM5B3KS81 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms