Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAMB4A4D0S4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms