Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms