Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEC23IPQ9Y6Y8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms