Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AUP1Q9Y679 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms