Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms