Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2J1Q9Y385 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBE2J1Q9Y385 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2J1Q9Y385 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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