Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AP3M1Q9Y2T2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms