Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD4AQ9UPU9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD4AQ9UPU9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms