Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRID1Q9ULK0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms