Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNIKQ9UKE5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNIKQ9UKE5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms