Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMEB2Q9UKD1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms