Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL1Q9UK58 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL1Q9UK58 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms