Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS7AQ9UBW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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