Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HCN3Q9P1Z3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HCN3Q9P1Z3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms