Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHCHD3Q9NX63 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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