Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SDHAF2Q9NX18 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms