Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
LINC00846Q9NV44 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms