Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM106BQ9NUM4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms