Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NIT2Q9NQR4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms