Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MEPEQ9NQ76 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MEPEQ9NQ76 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms