Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ASCL3Q9NQ33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ASCL3Q9NQ33 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms