Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GGNBP2Q9H3C7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms