Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAB3GAP2Q9H2M9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB3GAP2Q9H2M9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms