Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAB1BQ9H0U4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms