Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CIPCQ9C0C6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CIPCQ9C0C6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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