Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHANK3Q9BYB0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms