Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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