Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP58Q9BVL2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms