Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PI4K2AQ9BTU6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PI4K2AQ9BTU6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms