Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GAL3ST1Q99999 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GAL3ST1Q99999 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms