Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX18Q96RF0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX18Q96RF0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms