Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
JSRP1Q96MG2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
JSRP1Q96MG2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms