Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRRC1Q96M27 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms