Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF354BQ96LW1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms