Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MALSU1Q96EH3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MALSU1Q96EH3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms