Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELP4Q96EB1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELP4Q96EB1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms