Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTERF3Q96E29 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTERF3Q96E29 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms