Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UTP4Q969X6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms