Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NME8Q8N427 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NME8Q8N427 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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NME8Q8N427 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NME8Q8N427 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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NME8Q8N427 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NME8Q8N427 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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