Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PPFIBP1Q86W92 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PPFIBP1Q86W92 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms